Чуть выше монастыря, на Монастырской горе находится крепость Каламита. Как предполагают учёные, укрепление это возникло в VI—VIII вв. Построено византийцами для прикрытия торгового пути, который вёл из степного Крыма в Херсон.
В XIV—XV вв. Каламита принадлежала княжеству Феодоро. В 1475 г. её захватили турки и переименовали в Ин-Кермен («пещерная крепость»), что и дало название возникшему здесь городу. Оборонительные сооружения и монастырь сильно пострадали во время Великой Отечественной войны 1941 — 1945 гг. С 1991г. началось постепенное возрождение монастыря.
